Visão geral
David Haussler (nascido em outubro de 1953) é um bioinformata estadunidense reconhecido por liderar a equipe que montou a primeira sequência do genoma humano no âmbito do Projeto Genoma Humano e por contribuições subsequentes à análise comparativa de genomas, aprofundando o entendimento da função molecular e da evolução genômica. É diretor científico do UC Santa Cruz Genomics Institute, professor distinto de Engenharia Biomolecular na UC Santa Cruz e cofundador da Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH). Sua pesquisa integra matemática, ciência da computação e biologia molecular, com foco em modelos estatísticos para genômica, evolução humana e desenvolvimento de ferramentas como o UCSC Genome Browser.
Formação acadêmica
Haussler obteve o bacharelado em Matemática pela Connecticut College em 1975, o mestrado em Matemática Aplicada pela California Polytechnic State University em 1979 e o doutorado em Ciência da Computação pela University of Colorado Boulder em 1982, sob orientação de Andrzej Ehrenfeucht. Sua tese tratou de operações em linguagens formais.
Carreira
Atuou como professor assistente na University of Denver de 1982 a 1986. Desde 1986, está na UC Santa Cruz, inicialmente no Departamento de Ciência da Computação e, a partir de 2004, como membro inaugural do Departamento de Engenharia Biomolecular. É diretor científico fundador do UC Santa Cruz Genomics Institute e já dirigiu o California Institute for Quantitative Biosciences (QB3) no campus. Foi investigador do Howard Hughes Medical Institute (HHMI) e mantém afiliações como professor consultor na Stanford University School of Medicine e na UC San Francisco.
Principais contribuições
Haussler é pioneiro no uso de modelos de Markov ocultos (HMMs), gramáticas livres de contexto estocásticas e métodos de kernel discriminativo para análise de sequências de DNA, RNA e proteínas. Liderou a montagem computacional do primeiro rascunho público do genoma humano, disponibilizado na internet em 7 de julho de 2000, com trabalho de programação de Jim Kent. Desenvolveu o UCSC Genome Browser, ferramenta amplamente utilizada em pesquisas biomédicas. Cofundou o Genome 10K Project (atualmente Vertebrate Genomes Project) e a GA4GH para padronização e compartilhamento de dados genômicos. Iniciou projetos como o BRCA-exchange, o Human Pangenome Reference Consortium e o Treehouse Childhood Cancer Project. Atualmente, seu laboratório utiliza organoides cerebrais humanos para estudar evolução neural, neurodesenvolvimento e doenças, integrando CRISPR e sequenciamento de RNA de célula única.
Prêmios e reconhecimentos
É membro da National Academy of Sciences (2006), da National Academy of Engineering (2018) e da American Academy of Arts and Sciences, além de fellow da AAAI e da AAAS. Recebeu o Dan David Prize (2015), Weldon Memorial Prize (2011), Curt Stern Award (2009), ISCB Senior Scientist Award (2008), Dickson Prize (2005) e ACM/AAAI Allen Newell Award (2003). Em 2025, foi eleito Fellow da National Academy of Inventors.
Linha do tempo
- 1953: Nascimento em outubro.
- 1982: Conclusão do doutorado na University of Colorado Boulder.
- 1986: Ingresso na UC Santa Cruz.
- 2000: Publicação do primeiro rascunho público do genoma humano (7 de julho).
- 2004: Fundação do UC Santa Cruz Genomics Institute; ingresso no Departamento de Engenharia Biomolecular.
- 2006: Eleição para a National Academy of Sciences.
- 2015: Prêmio Dan David.
- 2018: Eleição para a National Academy of Engineering.
- 2025: Eleição como Fellow da National Academy of Inventors.